Characterization of a Novel Fatty Acid-Modifying Pathway in the Biosynthesis of Tambjamine BE-18591 in <i>Streptomyces</i>
Notice bibliographique
Résumé
Tambjamines are a class of bacterial bipyrrolic natural products with potent biological activity. Recently, the first actinomycete biosynthetic gene cluster (BGC) responsible for the production of a tambjamine (BE-18591) was discovered in Streptomyces albus, and bioinformatic analysis suggested the alkylamine tail component is constructed using different biosynthetic logic than employed by Proteobacteria to assemble structurally similar tambjamines YP1 and MYP1. Here, we report the experimental characterization of four novel streptomycete proteins and demonstrate that these enable the unique, late-stage assembly of the alkylamine tail of BE-18951. Specifically, a fatty acyl-carrier protein (TabQ) is loaded with a 12-carbon acyl chain, selected for, in part, through the action of an editing type II thioesterase (TabJ). The resulting C 12 –TabQ adduct is then processed to an aldehyde by a novel acyl-ACP reductase (TabE) that harbors none of the telltale amino acid signatures that typically identify these proteins. The resulting aldehyde is finally converted to the amine by an ω-transaminase (TabA) that demonstrates some degree of promiscuity. Our findings highlight the disparate chemical logic employed by Proteo- and Actinobacteria for the biosynthesis of the alkylamine components of tambjamine natural products.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».