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Enregistrement W4415945650 · doi:10.1101/2025.11.05.686795

Ecological coherence in abundance dynamics across terrestrial and marine assemblages

2025· preprint· W4415945650 sur OpenAlexafffund
Alexandre Fuster‐Calvo, Katherine Hébert, Aleksandra Dolezal, Christine Parent, François Massol, Mia Tayler Waters, Dominique Gravel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcGill UniversityUniversity of GuelphUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTaxonAbundance (ecology)Coherence (philosophical gambling strategy)MacroecologyCommunity structureRelative species abundancePairwise comparisonCommunitySpecies richness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Understanding how communities respond to environmental change requires assessing not just overall variability but also the structure of co-variation among taxa. We frame this idea under the Ecological Coherence (EC) framework, which generalizes previous notions such as community synchrony or coherence. EC captures the structure of co-responses among taxa within assemblages and can be expressed through two complementary objects: (1) the co-response matrix C , which contains all pairwise correlations between taxa and can be used to identify clusters of taxa with coherent responses as well as the contributions of individual species to community-wide coherence; and (2) the EC distribution , which summarizes the overall profile of co-responses by capturing their shape, spread, and central tendency across the community. By combining these two views, EC moves beyond single summary metrics and provides a richer picture of how coherence is organized within communities. Analyzing the EC distribution across 341 terrestrial and 105 marine assemblages worldwide, we found a general prevalence of weak correlations and a few strong, directional correlations. We also found that it varies with community composition, sampling effort, and biogeographic region. Moreover, the C matrix consistently identified a small subset of taxa with strong correlations to many others, suggesting a promising path to detecting those that may play central roles in amplifying or buffering community responses to environmental change. Our findings on EC pave the way for deeper investigations into what drives the diversity of ecological responses to environmental changes and how it shapes community dynamics, while also underscoring the need for strategically distributing ecological monitoring across trophic guilds and functional roles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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