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Enregistrement W4415975115 · doi:10.1101/2025.11.04.25339533

Electronic health record (EHR)-detectable statin intolerance phenotypes: Prevalence and validation in real-world general practice

2025· preprint· W4415975115 sur OpenAlexaff
Shagoofa Rakhshanda, Joel Rhee, Siaw‐Teng Liaw, Kerry‐Anne Rye, Jitendra Jonnagaddala

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensKensington Health
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilUniversity of New South WalesNvidia
Mots-clésStatinElectronic health recordMyopathyHealth recordsJudgementExercise intoleranceGeneral practiceClinical Practice

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Aims This study focused on patients who were prescribed statins as primary prevention of cardiovascular diseases. This study aimed to identify statin intolerant patients and determine the prevalence of statin intolerance by implementing electronic health record (EHR)-detectable statin intolerance electronic phenotyping algorithms, and to validate these algorithms. Methods This study used the Electronic Practice Based Research Network (ePBRN) dataset. The methodology took place in four stages: (1) literature review to identify electronic phenotypes, (2) implementation of electronic phenotypes on ePBRN, (3) development and implementation of reference standard, (4) validation of electronic phenotypes. Results Six EHR-detectable statin intolerance electronic phenotypes were identified, including the Minnesota Combined Rule-Based algorithm, Japan-Statin induced myopathy (SIMs), USA-SIMs, Singapore-SIMs (algorithms A, B, C, and D), Japan-Statin-associated muscle toxicity (SAMT), and NHS-UK-Statin intolerance pathway. The prevalence of statin intolerance among those prescribed statins in ePBRN was 5.09%. The Singapore SIMs-B algorithm showed the highest accuracy (57.05%), sensitivity (92.95%), negative predictive value (43.43%), and F1 (71.51%) scores, while the Japan SAMT algorithm showed the highest specificity (99.13%), positive predictive value (76.19%), and correlation coefficient (0.05%). Conclusion The prevalence of statin intolerance in ePBRN is at the low end of the 5–15% range reported in Australia and globally. The differences in prevalence calculations may be due to the varying definitions of intolerance. Our findings suggest that EHR-detectable phenotypes should be used as decision-support aid rather than as definitive diagnostic tools and that clinical judgement and patient engagement are necessary for the management of suspected statin intolerance. Key points This study found that: The prevalence of statin intolerance among those prescribed statins in the ePBRN dataset was 5.09%, which is at the low end of the 5–15% range reported in Australia and globally. Different phenotyping algorithms show various prevalence estimations, which may be due to the varying definitions of intolerance. EHR-detectable phenotypes should be used as decision-support aids rather than as definitive diagnostic tools and that clinical judgement and patient engagement is necessary for the management of suspected statin intolerance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,070
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,082

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,070
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
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