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Enregistrement W4415976494 · doi:10.1101/2025.11.04.25339178

Recessive genomic and phenotypic variation in consanguineous families with cerebral palsy

2025· preprint· en· W4415976494 sur OpenAlexaff
Pritha Bisarad, Yung-Chun Wang, Peter T. Skidmore, Carolina I. Galaz-Montoya, Sara A. Lewis, Bader Alhaddad, Nahyun Kong, Dominic Julian, Helen Magee, Tyler N. Kruer, Yuhan Xie, Wangjie Zheng, Boyang Li, Fatemeh Vand Rajabpour, James Liu, Anjali Revanur, Khadijah Bakur, Saghar Ghasemi Firouzabadi, Sarina Sharbatkhori, Abbas Tafakhori, Ehsan Taghiabadi, Ermia Nezaminargabad, Shohreh Vosoogh, Javad Jamshidi, Serajaddin Arefnia, Seyed Ahmad Hosseini, Alireza Khajehmirzaei, Faezeh Jamali, Azadeh Ahmadifard, Hamidreza Khodadadi, P. Daneshmand, Saeed Bohlega, Sateesh Maddirevula, Seba Nadeef, Mustafa A. Salih, Inaam N. Mohmed, Heinrich Sticht, Sara Peres Morias, Joana Damásio, Mariana Santos, José Leal Loureiro, Rita Rodrigues, Giovanni Stévanin, Mehdi Benkirane, Benjamin Dauriat, Nicholas Head, Júlia Baptista, Saeid Shahhosseini, Farhan Mohammad, Hongyu Zhao, Sergio Padilla‐Lopez, Fowzan S. Alkuraya, Somayeh Bakhtiari, Michael C. Kruer, Sheng Chih Jin, Hossein Darvish

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCerebral Palsy AllianceCerebral Palsy Alliance Research FoundationChildren's Discovery Institute
Mots-clésConsanguinityPhenotypeMendelian inheritanceGeneMultifactorial InheritanceAlleleGenetic variationInheritance (genetic algorithm)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Cerebral palsy (CP) is a neurodevelopmental disorder of motor function, with genetic etiologies, particularly de novo variants, identified in approximately one-third of cases. The contribution of consanguinity – long-recognized as a CP risk factor – has remained undefined. Here, we report findings from 188 primarily consanguineous Middle Eastern families with CP and identified putative causative genes in nearly three-quarters. The majority demonstrated recessive inheritance, although multi-level consanguinity and multilocus pathogenic variants complicated Mendelian assortment analyses. We identified 110 known CP-associated genes – five with phenotypic expansions and three others exhibiting new recessive inheritance patterns – and 24 novel candidates. We characterized ten candidates as high-confidence based on independent replication and protein modeling. We experimentally validated a role for SUCO variants in CP and newly identified a role for mid-gestational migrating excitatory neurons in the disorder. These findings highlight new genes, pathways, and phenotypes that reveal striking genomic diversity in CP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,145
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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