Identification of a VHL germline deletion in a family with Von Hippel-Lindau syndrome using MLPA-NGS
Notice bibliographique
Résumé
Von Hippel-Lindau syndrome (VHL) is an autosomal dominant disorder characterized by the development of tumors and cysts in multiple organs. Pathogenic variants in VHL are known to be associated with the development of this syndrome. Therefore, the present study aimed to investigate VHL rearrangements in a family with VHL syndrome. In the proband, who presented with retinal hemangioma, whole exome sequencing (WES) revealed significant genetic variation. However, WES did not detect germline deletion in VHL in the proband's son. Furthermore, multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA)-next-generation sequencing (NGS) analysis showed that the genomes of the proband and her son encompassed a deletion in VHL, extending from exon 2 to exon 3. Via increasing the probe density to gradually approach the breakpoint and following Sanger sequencing analysis, it was verified that an intermediate fragment of 6,662 bp was lost, with a reconnection occurring between chromosome 3:10145434 and 10,152,097 (GRCh38/hg38). Overall, the present study demonstrated that the application of MLPA-NGS technology combined with Sanger sequencing could be employed to precisely locate deleted DNA fragments.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».