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Enregistrement W4415996150 · doi:10.3389/fvets.2025.1568468

Evaluation of spatial variation in chronic wasting disease risk with Bayesian Poisson log-Gaussian model

2025· article· en· W4415996150 sur OpenAlexaboutno aff
Ram K. Raghavan, Frank Osei, Alfred Stein, Shane Hesting, Levi Jaster, Bijaya Hatuwal

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Fish and Wildlife ServiceKansas Department of Wildlife and ParksUniversity of Missouri
Mots-clésChronic wasting diseaseCovariateSpatial epidemiologySpatial variabilityPoisson regressionPoisson distributionSpatial analysisBayes' theoremBayesian probability

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic wasting disease (CWD) is a fatal neurodegenerative disease among cervids that has steadily spread across the United States and Canada. The year-to-year increase in the geographic spread of this disease among white-tailed deer and mule deer have raised concerns about conserving these species and sustainable big-game hunting. Knowledge of the spatial variation in CWD risk in Kansas, a state that attracts big game hunters nationwide is not fully understood. We explored the spatial variation in CWD risk and the potential effects of habitat-level covariates using surveillance data collected in Kansas from 2005 to 2023, with a Poisson log-Gaussian model in a Bayesian framework. Two models were considered; Model 1 included only spatial random effects and Model 2 included spatial random effects plus non-linear effects of habitat-level covariate. Following satisfactory convergence of model parameters, choropleth maps of posterior mean estimates for the risk of CWD presence, and measures of spatial heterogeneities were plotted. The impacts of the habitat-level covariates were deemed important predictors of CWD as Model 2 outperformed Model 1. The risk of CWD in the northwestern and southcentral portions of the state is likely driven by similar underlying spatial processes; however, no global smoothing effect was observed. The northwestern region is at higher risk for CWD presence but a gradual increase in risk toward the south and eastern sides of the state is apparent. We conclude that the data-driven Poisson log-Gaussian model is useful in assessing CWD and potentially other wildlife diseases from surveillance sources, and the different spatial patterns and habitat-level covariate association have relevance to CWD management in Kansas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,052
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,113

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,052
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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