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Enregistrement W4416004041 · doi:10.1021/acs.jpca.5c06238

Influence of Electron-Donating and Electron-Withdrawing Groups on One- and Two-Photon Absorption Properties on Modified Adenine and Guanine Nucleobases

2025· article· en· W4416004041 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueNonlinear Optical Materials Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNucleobaseGuanineDipoleAbsorption (acoustics)Density functional theoryExcitationFluorescenceSubstitution (logic)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Fluorescent nucleobase analogues are valuable probes for nucleic acid structure and dynamics, yet rational design remains challenging. Here, we investigate one- and two-photon absorption (1PA and 2PA) properties of 66 modified adenine and guanine derivatives using linear response for 1PA and quadratic response theory combined with the two-state model (2SM) for 2PA, employing RI-CC2 and time-dependent density functional theory (CAM-B3LYP and MN15) approaches. Each system includes either electron-donating groups (EDGs: CH 3, NH 2, OCH 3, OH) or electron-withdrawing groups (EWGs: CF 3, NO 2, COOH, CN) attached at different positions on a phenyl ring appended to the parent adenine or guanine nucleobase. Phenylation enhances the brightness of the parent nucleobases and red-shifts the excitation wavelengths, λ 1PA, by up to 47 nm (i.e., 94 nm for λ 2PA ), while EDG/EWG substitution induces further shifts of up to 113 nm in λ 1PA (i.e., 226 nm for λ 2PA ), thereby extending 2PA activity into the near-infrared region. The largest 2PA responses are associated with substantial permanent dipole changes upon excitation (|Δμ| = [(μ 11, x – μ 00, x ) 2 + (μ 11, y – μ 00, y ) 2 + (μ 11, z – μ 00, z ) 2 ] 1/2 ≈ 13 Debye) and near-colinear alignment between the change in the permanent dipole moment (Δ μ ) and the transition dipole moment (μ 01 ), cos 2 θ ≈ 1, as captured by the 2SM. While EDG substitution enhances the photophysical response relative to the parent nucleobases, EWG substitution leads to the most pronounced improvements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,355

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle