Toward an all-in-one recombinant adeno-associated virus vector for functionally ablating the prion gene using CRISPR-Cas technology
Notice bibliographique
Résumé
Any strategy that can selectively and persistently lower the brain levels of the cellular prion protein (PrPC) is expected to extend survival in prion diseases. Recent advances in the virus-mediated delivery of gene therapies prompted us to explore if a recombinant adeno-associated virus (rAAV) vector delivering a CRISPR-Cas-based gene editor can be devised that induces a functional knockout of the prion gene. Whereas the eventual objective is to assess the therapeutic potency of an optimized vector in prion-infected mice, in this proof-of-concept study, we evaluated tools and methods that are suited to achieve this goal. The result of these efforts is a first-generation all-in-one rAAV vector that codes for a prion gene-specific guide RNA and a small Cas9 endonuclease, whose expression is controlled by a truncated neural cell adhesion molecule 1 (NCAM1) promoter that is active in PrPC expressing cells. We also constructed a second rAAV vector coding for a prion gene-specific 'traffic light reporter' (TLR). The TLR can be used to monitor prion gene-editing efficacy by coding for red and green fluorescent proteins separated by a segment of the prion gene that is targeted by the gene editor. For the purification of AAVs, we adopted a robust and scalable rAAV vector assembly pipeline and undertook proof-of-concept prion gene editing experiments in human cells and mice, which to date yielded prion gene editing rates of approximately 20% and 5%, respectively. Finally, we compared brain distributions of rAAV vectors following intrathalamic versus retro-orbital injection, and selected the 9P31 capsid for future studies based on a 7.5-fold higher heterologous gene expression level as compared to the PHP.eB capsid.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».