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Enregistrement W4416050261 · doi:10.48550/arxiv.2508.14936

Can synthetic data reproduce real-world findings in epidemiology? A replication study using adversarial random forests

2025· preprint· en· W4416050261 sur OpenAlexaboutno aff
Jan Kapar, Kathrin Günther, Lori Ann Vallis, Klaus Berger, Nadine Binder, Hermann Brenner, Stefanie Castell, Beate Fischer, Volker Harth, Bernd Holleczek, Timm Intemann, Till Ittermann, André Karch, Thomas Keil, Lilian Krist, Berit Lange, Michael F. Leitzmann, Katharina Nimptsch, Nadia Obi, Iris Pigeot, Tobias Pischon, Tamara Schikowski, Börge Schmidt, Carsten Oliver Schmidt, Anja M. Sedlmair, Justine Tanoey, Harm Wienbergen, Andreas Wienke, Claudia Wigmann, Marvin N. Wright

Notice bibliographique

RevueMDC Repository (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesLeibniz-GemeinschaftDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean CommissionBundesministerium für Bildung und ForschungFreie Hansestadt Bremen
Mots-clésSynthetic dataReplication (statistics)Curse of dimensionalityGenerative modelDimensionality reductionData qualityStability (learning theory)Generative grammarStatistical model

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Synthetic data hold substantial potential to address practical challenges in epidemiology due to restricted data access and privacy concerns. However, many current methods suffer from limited quality, high computational demands, and complexity for non-experts. Furthermore, common evaluation strategies for synthetic data often fail to directly reflect statistical utility and measure privacy risks sufficiently. Against this background, a critical underexplored question is whether synthetic data can reliably reproduce key findings from epidemiological research while preserving privacy. METHODS: We propose adversarial random forests (ARF) as an efficient and convenient method for synthesizing tabular epidemiological data. To evaluate its performance, we replicated statistical analyses from six epidemiological publications covering blood pressure, anthropometry, myocardial infarction, accelerometry, loneliness, and diabetes, from the German National Cohort (NAKO Gesundheitsstudie), the Bremen STEMI Registry U45 Study, and the Guelph Family Health Study. We further assessed how dataset dimensionality and variable complexity affect the quality of synthetic data, and contextualized ARF's performance by comparison with commonly used tabular data synthesizers in terms of utility, privacy, generalization, and runtime. RESULTS: Across all replicated studies, results on ARF-generated synthetic data consistently aligned with original findings. Even for datasets with relatively low sample size-to-dimensionality ratios, replication outcomes closely matched the original results across descriptive and inferential analyses. Reduced dimensionality and variable complexity further enhanced synthesis quality. ARF demonstrated favourable performance regarding utility, privacy preservation, and generalization relative to other synthesizers and superior computational efficiency. CONCLUSIONS: In summary, ARF reliably generates high-quality synthetic data that replicate diverse epidemiological analyses while offering a competitive privacy-utility trade-off.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,058
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,172
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,942
Score d'incertitude au seuil0,305

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0580,172
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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