First Report of Cystobasidium slooffiae in Human Wounds from China: Molecular Identification and Clinical Insights
Notice bibliographique
Résumé
Background: Cystobasidium spp. are rare yeasts recently recognized as emerging human pathogens. This study presents the first report from China of Cystobasidium slooffiae isolated from human wound infections, and characterizes its microbiological profile, phylogenetic identity, and antifungal susceptibility. Methods: Two strains were isolated from skin wounds of immunocompromised patients. They were characterized based on colony morphology on Sabouraud dextrose agar, Gram staining, MALDI-TOF MS analysis, Erg11 amino acid sequences analysis, and phylogenetic analysis using combined sequences of 18S rDNA, D1/D2 domains, and ITS regions. Antifungal susceptibility testing was performed according to CLSI guidelines (M27-A3/M60). Results: The colonies transitioned from light yellow to orange within 48– 96 h with Gram-positive budding cells. MALDI-TOF MS failed to identify accurately any of these strains. However, phylogenetic analysis of ITS confirmed that both strains were C. slooffiae . Both strains exhibited high minimum inhibitory concentrations (MICs) for all three echinocandins (> 8 μg/mL) and fluconazole (32– 64 μg/mL), whereas the MICs for isavuconazole were in the range 0.75– 1 μg/mL. Erg11 sequence analysis revealed they formed a distinct clade that was genetically distant from Rhodotorulaceae. Conclusion: Our findings showed that C. slooffiae could be an important emerging, opportunistic human invasive fungal pathogen because of its reduced susceptibility to echinocandins and fluconazole. Keywords: Cystobasidium slooffiae , skin wounds, superficial infections, Rhodotorula
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».