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Enregistrement W4416077476 · doi:10.1021/jacs.5c11789

MOF-ChemUnity: Literature-Informed Large Language Models for Metal–Organic Framework Research

2025· article· en· W4416077476 sur OpenAlexafffund
Thomas Michael Pruyn, Amro Aswad, Sartaaj Takrim Khan, Ju Huang, Robert Black, Seyed Mohamad Moosavi

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMetal-Organic Frameworks: Synthesis and Applications
Établissements canadiensVector InstituteNational Research Council CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of TorontoCanada First Research Excellence FundNational Research Council CanadaConcordia UniversitySchmidt Futures
Mots-clésLeverage (statistics)InferenceKnowledge graphScalabilityTrustworthinessApplications of artificial intelligenceKnowledge baseScope (computer science)Information extractionGraph

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Artificial intelligence (AI) is transforming research in metal-organic frameworks (MOFs), where models trained on structured computational data routinely predict new materials and optimize their properties. This raises a central question: What if we could leverage the full breadth of MOF knowledge, not just structured data sets, but also the scientific literature? For researchers, the literature remains the primary source of knowledge, yet much of its content, including experimental data and expert insight, remains underutilized by AI systems. We introduce MOF-ChemUnity, a structured, extensible, and scalable knowledge graph that unifies MOF data by linking literature-derived insights to crystal structures and computational data sets. By disambiguating MOF names in the literature and connecting them to crystal structures in the Cambridge Structural Database, MOF-ChemUnity unifies experimental and computational sources and enables cross-document knowledge extraction and linking. We showcase how this enables multiproperty machine learning across simulated and experimental data, compilation of complete synthesis records for individual compounds by aggregating information across multiple publications, and expert-guided materials recommendations via structure-based machine learning descriptors for pore geometry and chemistry. When used as a knowledge source to augment large language models (LLMs), MOF-ChemUnity enables a literature-informed AI assistant that operates over the full scope of MOF knowledge. Expert evaluations show improved accuracy, interpretability, and trustworthiness across tasks such as retrieval, inference of structure-property relationships, and materials recommendation, outperforming standard LLMs. This work lays the foundation for literature-informed materials discovery, enabling both scientists and AI systems to reason over the full existing knowledge in a new way.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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