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Enregistrement W4416083774 · doi:10.1101/2025.11.08.687368

Comparison of volumetric dynamic optical coherence tomography with biological methods for evaluation of radiation effects in prostate tumor spheroids

2025· preprint· W4416083774 sur OpenAlexafffund
Steph Swanson, Keyu Chen, Elahe Cheraghi, Ernest Osei, Kostadinka Bizheva

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineEngineering
ThématiqueOptical Coherence Tomography Applications
Établissements canadiensRegional Municipality of WaterlooUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchProstate Cancer Fight FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacs
Mots-clésClonogenic assaySpheroidOptical coherence tomographyProstateProstate cancerRadiation therapyFluorescence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Significance 3D tumor spheroids are more physiologically representative of in vivo patient tumors compared to 2D monolayer culture. However, their 3D nature challenges the use of conventional biological techniques like proliferation assays, fluorescence microscopy, and the clonogenic assay, which is the gold standard method for assessing cell survival following radiation. However, clonogenic assay requires spheroid disaggregation. Aim Non-invasive volumetric imaging with dynamic optical coherence tomography (dOCT) enables cellular activity to be visualized with spatial resolution within 3D tumor spheroids. Cellular activity observed via dOCT in irradiated prostate tumor spheroids was quantified for comparison with conventional biological techniques. Approach A Varian TrueBeam linear accelerator was used to irradiate spheroid and monolayer cultures with a 6 MV beam. Cellular activity was estimated from dOCT images generated via frequency banding and compared to clonogenic assay, proliferation assay, fluorescence microscopy, and 3D cell simulation. Results Prostate cancer cells cultured as spheroids demonstrated improved radio-resistance via clonogenic assay compared to monolayer culture. The dOCT method demonstrated quantitative and qualitative agreement with proliferation assay and fluorescence microscopy, respectively. Conclusions A longer duration of repeated dOCT measurement in tumor spheroids following radiation treatment could offer a non-invasive alternative to the clonogenic assay.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,360
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0020,009
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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