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Enregistrement W4416084826 · doi:10.1093/neuonc/noaf201.0005

EPCO-05. AN ONCOGENIC PHOTORECEPTOR PROGRAM UNIFIES DISTINCT CENTRAL NERVOUS SYSTEM TUMORS

2025· article· en· W4416084826 sur OpenAlexaff
Brian Gudenas, Shiekh Tanveer Ahmad, Bernhard Englinger, Anthony Liu, Miao Zhao, Leena Paul, Jennifer Hadley, Hong Lin, Yiran Li, Melissa Batts, Priya Mittal, Stephanie Wu, Sara A. Lewis, Katie Han, Taha Soliman, Laura J. Janke, David M. Meredith, Elke Pfaff, Johannes Gojo, Jennifer Cotter, Paul Klimo, Frederick A. Boop, Amar Gajjar, Giles Robinson, Gabriela Rosén, Sanda Alexandrescu, David Jones, Brent A. Orr, Fredrik J. Swartling, Mariella G. Filbin, Paul A. Northcott

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSickKids Foundation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeTranscription factorCentral nervous systemMedulloblastomaRetinoblastomaTranscription (linguistics)PhenotypeReprogramming

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pineoblastoma (PB) is a clinically aggressive embryonal central nervous system (CNS) tumor composed of distinct molecular subgroups. The cellular and biological basis of PB remains poorly defined, limiting the development of more effective therapeutic strategies. To identify the cellular composition, origins, and drivers of PB, we derived single-cell transcriptomes from patient-derived pineal tumors (n=38) and integrated malignant cells with a novel transcriptional atlas of mouse pineal gland development (E13-P21). Application of a series of computational strategies pinpointed transient, cycling pinealocyte progenitors as the likely cellular origin of PB, irrespective of molecular subgroup. To functionally validate these findings, we generated lineage-specific genetically engineered mouse (GEM) models representing distinct PB subgroups with high temporal, anatomic, and phenotypic fidelity. Transcriptomic analysis further substantiated the accuracy of novel GEM models which converged on cell-cycle dysregulation, highlighting a core pathogenic mechanism across PB subgroups. Relative to the developing pineal gland, photoreceptor transcription factors were aberrantly activated in PB GEM models, suggesting photoreceptor involvement in tumor initiation and/or maintenance. Multi-omic analysis across a large range of diverse CNS cancers revealed an oncogenic photoreceptor program specific to PB, retinoblastoma (RETB), and Group 3 medulloblastoma (G3-MB). This shared transcriptional program was active within respective cellular origins, establishing a unified mechanistic basis across these anatomically distinct CNS tumors. CRISPR-based functional studies confirmed selective dependencies of photoreceptor transcription factors (NRL, CRX, OTX2) in PB, RETB and G3-MB, demonstrating the essentiality of this photoreceptor program. These discoveries not only resolve longstanding uncertainties regarding PB pathogenesis but also highlight conserved molecular signatures and therapeutic vulnerabilities spanning different pediatric CNS malignancies. Our results underscore the potential of targeting developmentally regulated programs and master transcription factors as novel therapeutic strategies for PB, RETB, and G3-MB, offering critical insights and preclinical models for future translational research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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