DNAR-11. Differential DNA Damage and Repair burden in proliferating neural progenitor cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract While radiation therapy offers strong anti-cancer benefits, it can also have serious side effects for children undergoing brain tumor treatment. These include disruptions in white matter development, delays in functional and cognitive growth, and an increased risk of secondary tumors within the area that was treated. Age-dependent susceptibility to these adverse effects is tightly linked to critical windows of neurodevelopment, particularly during the periods of active neural cell differentiation, maturation, and the rapid onset of myelination in infancy and early childhood. We previously demonstrated that oligodendrocyte precursor cells (OPCs) exhibit heightened sensitivity to IR-induced DNA damage compared to other neural stem/progenitor cells (NSPC) populations – a difference that is associated with their decreased ability to form RAD51 filaments (a critical step in RAD51-mediated homologous recombination repair of DNA double-strand breaks). Recently, we performed genome-wide chromatin immunoprecipitation followed by sequencing (ChIP-seq) to map endogenous γH2AX binding sites—a sensitive marker of DNA damage response—in both S-phase OPCs and NSPCs. Our data identified 71,794 γH2AX-enriched regions in OPCs versus 29,154 in NSPCs, highlighting the elevated genotoxic stress burden in OPCs. Interestingly, we observed γH2AX binding is depleted at transcription start sites and transcription termination sites, however OPCs show more γH2AX peaks compare to NSPCs across all protein-coding genes. Furthermore, our data show cell type specific γH2AX binding sites. Together, these findings establish a comprehensive and unbiased genomic framework for elucidating the mechanisms underlying OPC vulnerability to DNA damage. Future studies will examine different DNA damage pattern in response to radiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».