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Enregistrement W4416086983 · doi:10.1101/2025.11.07.687293

Impact of Voluntary Wheel Running on Gene Expression of Histone 3 Lysine 27-Modifying Enzymes in Mouse Skeletal Muscle

2025· preprint· W4416086983 sur OpenAlexaff
Daniel Gamu, Makenna S. Cameron, Yasmeen Jalil, Imen Zouaoui, J Sangha, Jonathan Kim

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHistoneChromatinSkeletal muscleAcetylationHistone methyltransferaseLysineGene expressionHistone H3Methyltransferase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Skeletal muscle is highly plastic and capable of remodelling its contractile and metabolic properties depending on physical demands. Such remodelling requires modification of chromatin structure to support transcriptional activation and suppression of gene programs. Chromatin dynamics depend, in part, on the acetylation and methylation of histone 3 lysine 27 (H3K27), which is controlled by several H3K27-specific acetyltransferases, deacetylases, methyltransferases and demethylases. Several histone post-translational modifications in muscle have been shown to be modulated by exercise. Here, we sought to examine whether major H3K27 regulators are altered by endurance training. Male and female C57BL/6J mice were provided with voluntary running wheels for 6 weeks and compared to sex-matched sedentary controls with locked running wheels. Gene expression of various slow/oxidative and fast/glycolytic skeletal muscles was then measured. We found voluntary running induced modest changes in H3K27 acetyltransferases, along with several components of the polycomb-repressive complex 2 in a muscle- and sex-specific manner. Our findings indicate that the capacity for both acetylation and methylation of H3K27 is modulated by chronic endurance exercise, suggesting that chromatin dynamics are a mechanistic component of exercise-induced muscle remodelling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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