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Enregistrement W4416087199 · doi:10.3390/bioresourbioprod1020008

Identification and Characterization of the Delta-12 Fatty Acid Desaturase from Euglena gracilis

2025· article· en· W4416087199 sur OpenAlexafffund
Raj Kumar Thapa, Bijaya K. Uprety, R. J. Neil Emery, Scott C. Farrow

Notice bibliographique

RevueBioresources and Bioproducts · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesMitacs
Mots-clésEuglena gracilisLinoleic acidFatty acidFatty acid desaturaseDehydrataseOleic acidNicotiana benthamianaBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fatty acid desaturase 12 (FAD12) is a key enzyme in fatty acid biosynthesis, responsible for converting oleic acid to linoleic acid through desaturase activity. Euglena gracilis (Euglena) is an emerging platform for the industrial production of various metabolites, including lipids. However, a comprehensive understanding of Euglena’s fatty acid biosynthesis pathways remains incomplete, posing a significant barrier to the commercialization of Euglena bioproducts. To address this gap, we employed a bioinformatics approach to identify a Euglena gracilis FAD12 (Eg FAD12). We analyzed the evolutionary relationship of Eg FAD12 with its homologs from other organisms and revealed that the three canonical histidine box motifs are conserved among FAD12s. To characterize EgFAD12, we cloned it into the pEAQ-hyperstrans vector and overexpressed it in Nicotiana benthamiana to take advantage of its endogenous fatty acid pool, which could act as a substrate. The heterologous expression of FAD12 in N. benthamiana led to an increased linoleic acid content, demonstrating the suspected desaturase activity. To further confirm the function of Eg FAD12, we performed CRISPR-Cas9-mediated knockout of Eg FAD12 in Euglena, which resulted in a drastic reduction in linoleic acid (C18:2) without compromising biomass yield or lipid content. This work advances our understanding of fatty acid biosynthesis in Euglena and will aid in its adoption as a platform for producing customized lipids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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