Identification and Characterization of the Delta-12 Fatty Acid Desaturase from Euglena gracilis
Notice bibliographique
Résumé
Fatty acid desaturase 12 (FAD12) is a key enzyme in fatty acid biosynthesis, responsible for converting oleic acid to linoleic acid through desaturase activity. Euglena gracilis (Euglena) is an emerging platform for the industrial production of various metabolites, including lipids. However, a comprehensive understanding of Euglena’s fatty acid biosynthesis pathways remains incomplete, posing a significant barrier to the commercialization of Euglena bioproducts. To address this gap, we employed a bioinformatics approach to identify a Euglena gracilis FAD12 (Eg FAD12). We analyzed the evolutionary relationship of Eg FAD12 with its homologs from other organisms and revealed that the three canonical histidine box motifs are conserved among FAD12s. To characterize EgFAD12, we cloned it into the pEAQ-hyperstrans vector and overexpressed it in Nicotiana benthamiana to take advantage of its endogenous fatty acid pool, which could act as a substrate. The heterologous expression of FAD12 in N. benthamiana led to an increased linoleic acid content, demonstrating the suspected desaturase activity. To further confirm the function of Eg FAD12, we performed CRISPR-Cas9-mediated knockout of Eg FAD12 in Euglena, which resulted in a drastic reduction in linoleic acid (C18:2) without compromising biomass yield or lipid content. This work advances our understanding of fatty acid biosynthesis in Euglena and will aid in its adoption as a platform for producing customized lipids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».