Thresholds adjustments and impact on clinical performance of three FIT assays in a colorectal cancer screening program
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Fecal immunochemical tests (FITs) from various manufacturers yield different results, leading to variable positivity rates and clinical performance. These differences can influence the healthcare costs of a colorectal cancer screening program (CRC-SP), specifically when switching among FIT manufacturers. The analytical and clinical performance of three FITs was investigated to determine adjusted thresholds using positivity rate harmonization. METHODS: A cohort of 6,600 participants from the Quebec CRC-SP received collection kits from three different manufacturers to sample the same fresh stool. Participants with positive results were referred for a colonoscopy which was considered positive if advanced neoplasia (AN) was detected. Positivity rates were determined for each FIT at an unadjusted threshold. Adjusted thresholds were determined using a positivity rate harmonization strategy. Clinical performance was then evaluated for each supplier at unadjusted and adjusted thresholds. RESULTS: Among 5,513 participants who fulfilled the inclusion criteria, 327 underwent colonoscopy. The FIT positivity rates at unadjusted thresholds differed between manufacturers. The adjusted thresholds determined to yield the same positivity rate were different for each FIT. A total of 69 participants were diagnosed with AN. Significant differences in concordance, discordance, sensitivity, and specificity were observed when using the unadjusted threshold. After applying adjusted thresholds, differences in clinical performance between manufacturers were no longer statistically significant. CONCLUSIONS: Threshold adjustment using a positivity rate harmonization strategy render differences in clinical performance statistically nonsignificant and leads to a stable colonoscopy rate between manufacturers. CRC screening programs should determine adjusted thresholds when changing FIT suppliers or when using multiple assays.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,037 | 0,073 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».