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Enregistrement W4416114508 · doi:10.1117/1.jbo.30.s2.s23901

Consensus guidelines for cellular label-free optical metabolic imaging: ensuring accuracy and reproducibility in metabolic profiling

2025· article· en· W4416114508 sur OpenAlexaff
Irene Georgakoudi, Melissa C. Skala, Kyle P. Quinn, Chiara Stringari, Janet E. Sorrells, Ahmed A. Heikal, Lin Z. Li, He N. Xu, Sixian You, Alex J. Walsh, Rupsa Datta, Kayvan Samimi, Amani A. Gillette, Kevin W. Eliceiri, Mihaela Balu, Stephen A. Boppart, Michelle A. Digman, Kylie R. Dunning, Conor L. Evans, Alba Alfonso‐García, Jessica P. Houston, Wonsang Hwang, Xingde Li, Zhiyi Liu, Laura Marcu, Sangeeta Murugkar, Michael G. Nichols, Raluca Niesner, Sapun H. Parekh, Narasimhan Rajaram, Suman Ranjit, K. Robert Shen, Lingyan Shi, Belén Torrado, Alexander Vallmitjana, Michael Evers, Roger J. Zemp

Notice bibliographique

RevueJournal of Biomedical Optics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of AlbertaCarleton University
Organismes subventionnairesLeadership LincolnNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesJapan Endocrine SocietyNational Heart, Lung, and Blood InstitutePerelman School of Medicine, University of PennsylvaniaAmerican Cancer SocietyNational Cancer InstituteInstitute for Translational Medicine and TherapeuticsNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringUniversity of PennsylvaniaAgence Nationale de la RechercheNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésProfiling (computer programming)ReproducibilityOptical imagingMetabolic activityMetabolic regulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance: Cellular metabolism plays a central role in health and disease, making its study critical for advancing diagnostics and therapies. Label-free optical metabolic imaging using endogenous fluorescence from reduced nicotinamide adenine dinucleotide (phosphate) [NAD(P)H] and flavin adenine dinucleotide (FAD) provides nondestructive, high-resolution insights into metabolic function and heterogeneity from the sub-cellular to the tissue level. Standardized approaches are essential to ensure reproducibility and comparability across studies. Aim: We aim to establish a consensus framework for the acquisition, calibration, and reporting of microscopic imaging metabolic function assessments based on fluorescence intensity and lifetime measurements of NAD(P)H and FAD. Approach: We present best practices for calibrating, analyzing, and reporting fluorescence intensity-based optical redox ratios and fluorescence lifetime data using multiexponential fitting and phasor analysis. Guidelines for validation experiments and cross-system standardization are provided to improve accuracy and reproducibility. Results: We demonstrate the importance of calibration procedures and normalization strategies for intensity-based optical redox measurements. We highlight needed calibration, signal-to-noise ratio considerations, and the impact of distinct analytical approaches on fluorescence lifetime-based metabolic function metrics. Conclusion: We recommend a consistent, practical framework for reproducible, label-free, optical metabolic imaging, facilitating robust comparisons across studies and supporting the broader adoption of optical metabolic imaging technologies for biomedical research and clinical translation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,679
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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