An Intronic Variant in <scp> <i>CDKN1C</i> </scp> Gene Causing <scp>IMAGe</scp> Syndrome in an Iranian Girl
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: IMAGe syndrome, a rare disorder caused by maternally inherited CDKN1C pathogenic variants, is characterized by intrauterine growth retardation (IUGR), metaphyseal dysplasia, adrenal hypoplasia congenita, and genitourinary abnormalities. We report a novel intronic CDKN1C variant in a 5-year-old Iranian girl with IMAGe syndrome. MATERIALS AND METHODS: Clinical evaluations showed severe IUGR (birth weight 1850 g), disproportionate short stature (height 88 cm, -4.4 Z score), metaphyseal dysplasia, adrenal insufficiency (ACTH 1110 pg/mL, low cortisol), and dysmorphic features (frontal bossing, low-set ears). Whole-exome sequencing (WES) was performed to identify causative genetic variants. RESULTS: WES revealed a heterozygous CDKN1C intronic variant, c.787+4A>T, absent from gnomAD, ExAC, and ClinVar. SpliceAI (score: 0.82) predicted disrupted splicing, potentially leading to a gain-of-function effect. The variant was consistently classified as a Variant of Uncertain Significance (VUS) according to ACMG/AMP 2015 guidelines with 2020 updates. No other pathogenic variants were identified in genes related to skeletal dysplasia, adrenal insufficiency, or growth retardation. Sanger sequencing confirmed maternal inheritance in the proband, her healthy mother, and grandfather, consistent with CDKN1C paternal imprinting. DISCUSSION: This case broadens the genetic spectrum of IMAGe syndrome by identifying the first reported intronic CDKN1C variant associated with this condition. WES is crucial for diagnosis, and RNA analysis is needed to confirm the variant's functional impact. Rapid diagnosis is essential for managing life-threatening adrenal insufficiency.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».