IPTG- and estradiol-inducible gene expression systems in the unicellular red alga <i>Cyanidioschyzon merolae</i>
Notice bibliographique
Résumé
The genetically tractable unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae has a remarkably simple genome (4,775 nucleus-encoded proteins) and cellular architecture. It contains only a single set of most membranous organelles, making it a valuable tool for elucidating the fundamental mechanisms of photosynthetic eukaryotes. However, as in other genetically tractable eukaryotic algae, previously developed systems for inducible gene expression rely on environmental stimuli such as heat shock or ammonium depletion, which impact cellular physiology and thus limit their usage. To overcome this issue, we developed IPTG- and estradiol-inducible gene expression systems in C. merolae in which the addition of these chemicals itself has no impact on cellular growth or the transcriptome. Additionally, we established IPTG- and estradiol-inducible protein knockdown systems and successfully degraded the endogenous chloroplast division protein DRP5B using the estradiol-inducible system. These systems facilitate functional genomic analyses in C. merolae, especially for understanding physiological mechanisms and their interactions in photosynthetic eukaryotes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».