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Enregistrement W4416155405 · doi:10.1101/2025.11.08.25339824

Genome-wide analysis in over 1.6 million participants uncovers 147 loci associated with obstructive sleep apnoea

2025· preprint· en· W4416155405 sur OpenAlexfundno aff
Luis M. García‐Marín, Zuriel Ceja, Jiawen Xu, Santiago Díaz‐Torres, Victor Flores‐Ocampo, Asma M. Aman, Mateo Maya-Martínez, Xueyan Huang, Aura Aguilar-Roldán, Bade Uckac, Fangyuan Cao, Natalia Ogonowski, Nicholas G. Martin, Stuart MacGregor, Xianjun Dong, Sarah J. Lewis, Jiao Wang, Miguel E. Rentería

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueObstructive Sleep Apnea Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchRebecca L. Cooper Medical Research FoundationQueensland University of TechnologyNational Institutes of HealthGovernment of CanadaQIMR Berghofer Medical Research InstituteMassachusetts General Hospital
Mots-clésHeritabilityGenome-wide association studySleep (system call)PopulationBody mass indexGABAergicGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT We conducted the largest GWAS meta-analysis for obstructive sleep apnoea (OSA; N cases = 230,657; N controls = 1,377,442) using European ancestry genetic data from five countries. We identified 147 independent loci associated with OSA, and estimated SNP-based heritability at 16%. We report six independent loci in a separate African population meta-analysis (N cases = 46,834; N controls = 149,192). We observed spatially resolved gene enrichment involving GABAergic and glutamate pathways, synaptic transmission, and cytoskeletal remodelling. OSA-derived polygenic risk scores showed predictive ability for clinician ascertained OSA status, Fitbit-derived sleep features, and self-reported sleep traits in participants of diverse ancestral backgrounds. We identified putative causal relationships with ADHD, depression, multisite chronic pain, body mass index, and schizophrenia, among others. Our findings demonstrate a robust genetic component underlying OSA risk, independent of body mass index, implicating distinct neurobiological pathways related to synaptic function and corticothalamic feedback loops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,006
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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