An Ehrlich-inspired retrobiosynthesis of pharmaceutical scaffolds
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Brewer’s yeast ( Saccharomyces cerevisiae ) acquires nitrogen from branched-chain and aromatic amino acids via the Ehrlich pathway, generating flavor (fusel) byproducts. Recently, diverting 4-hydroxyphenylacetaldehyde from Ehrlich catabolism of ʟ-tyrosine has enabled microbial production of opioids and other plant benzylisoquinolines. Yet, fusel metabolism is versatile in substrate scope, offering an untapped entry point for synthesizing structurally diverse aldehydes. Here, we repurpose the yeast Ehrlich pathway into a modular biocatalytic conduit for manufacturing privileged pharmaceutical alkaloids. We utilize retrobiosynthetic analysis and enzyme screening to derive scaffolds representative of solifenacin, colchicine, and ephedrine pharmaceuticals from simple amino acids. We survey wild yeasts for catabolism of ʟ-phenylglycine and demonstrate Ehrlich conversion to benzyl alcohol or ( R )-phenylacetylcarbinol by 29 strains across nine genera. Implementing an ω-transaminase enables production of norephedrine from a simple amino acid input. This work unveils a generalizable biocatalytic route to clinically important alkaloids by exploiting metabolic logic from a yeast flavor pathway.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».