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Enregistrement W4416203297 · doi:10.1101/2025.11.09.687440

<i>Leishmania donovani</i> GP63 paralogues cooperatively orchestrate visceral infection and persistence

2025· preprint· W4416203297 sur OpenAlexaff
Debolina Manna, Suvendu Nandi, Kristína Záhonová, S Deneshraj, Nidhi Pandey, Debarati Biswas, Mahitosh Mandal, Gayatri Mukherjee, Vyacheslav Yurchenko, Budhaditya Mukherjee

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, India
Mots-clésVirulenceAmastigoteInfectivityFunction (biology)MutantPhenotypeIntracellularCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Highly plastic genome of Leishmania is thought to underlie its remarkable ability to adapt to diverse host microenvironments, yet how this plasticity translates into dermal versus visceral persistence remains unclear. GP63, a zinc metalloprotease, is a well-established determinant of promastigote infectivity, particularly in cutaneous leishmaniasis. Despite this, its role in amastigote stage and in visceral disease caused by Leishmania donovani remains undefined. Here, using an integrated approach combining phylogenetics, CRISPR-mediated genome editing, and biochemical analyses, we demonstrate that GP63 paralogues in L. donovani have undergone independent evolutionary diversification to support visceral infection. While GP63-paralogues encoded on chromosome 10, previously implicated in cutaneous manifestation caused by L. major , were found severely truncated and dispensable in L. donovani, two distinct GP63-paralogues encoded on chromosome 28 and 31 were found ‘essential’ to establish visceral infection. LdGP63_31 facilitates promastigote attachment to macrophages by promoting lipid raft engagement and complement inactivation, thereby enabling host entry and subsequent amastigote differentiation. LdGP63_28 is essential for intracellular amastigote survival by suppressing host inflammatory pyroptosis. Structural and enzymatic analyses revealed preferential host localization and substrate specificities, possibly resulting from distinct amino acid substitution within conserved motifs of these proteases, indicating independent evolutionary adaptations. Importantly, loss of the LdGP63_28 more severely impaired amastigote reinfection than loss of its counterpart LdGP63_31. Together, these findings reveal coordinated functional specialization of GP63-paralogues ensuring visceral adaptation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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