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Enregistrement W4416203712 · doi:10.1186/s12866-025-04463-w

Plant identity and environmental filtering are the key drivers of bacterial community structure in four desert plant species from the Sahara Desert in Morocco

2025· article· en· W4416203712 sur OpenAlexaff
Hafsa Debbagh-Nour, Said Khourchi, Ayoub El Mouttaqi, Rachid Elfermi, Anass Bourazza, Oscar Pascal Malou, Marc Ducousso, Hassan Boukcim, Mohamed Hijri, Abdelaziz Hirich

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesUniversité Mohammed VI Polytechnique
Mots-clésDesert (philosophy)Key (lock)Plant speciesCommunity structurePlant communityCommunityDesert climateEntomology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Plant microbiome is a very wide research area playing a major role in agriculture and plant health. This study investigates the interactions between root-associated bacterial communities and soil physico-chemical characteristics of four Moroccan desert plant species: Lavandula coronopifolia Poir. (n = 20), Lycium intricatum Boiss. (n = 20), Nitraria retusa Asch. (n = 20) and Searsia tripartita (Ucria) Moffett. (n = 20). Soil samples were collected in the rhizosphere of each plant species, and root samples from four different sites, with five random samples per site. Elemental chemical composition of soil sample was analyzed using the X-Ray fluorescence spectrometry and soil carbon, i.e., organic carbon (SOC) and inorganic carbon (SIC) were measured using the Rock-Eval® Oxypure method. Roots were assessed for their microbial community, using the 16S rDNA metabarcoding analysis. RESULTS: Significant variation in soil parameters was observed across sites and among the four desert plant species. SOC and SIC contents were highest in soils associated with S. tripartita, N. retusa, and Ly. intricatum, while La. coronopifolia was associated with elevated levels of Si, Al, K, and Mn. Soil EC was highest in N. retusa and S. tripartita. Microbial analysis revealed that Pseudomonadota and Actinomycetota dominated the root-associated bacterial communities, comprising around 60% of total abundance. Alpha diversity (Shannon and Simpson indices) varied significantly across species and sites, especially in La. coronopifolia. Beta diversity analyzes confirmed that geographic location significantly influenced microbial community structure. Rhizosphere network complexity and composition varied by species, with N. retusa showing broad ecological tolerance, while S. tripartita communities were strongly shaped by SOC, SIC, K, Ca, Mn, and Fe. Mantel test results further highlighted that plant identity and environmental factors differentially influence root microbial composition across sites. CONCLUSION: Each plant species showed unique responses in terms of soil characteristics and microbial communities, highlighting the importance of adopting a species-specific approach.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,749
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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