Epidemiology and genetic characteristics of coxsackievirus A16 associated with hand-foot-mouth disease in Hangzhou city, Zhejiang province from 2021 to 2024
Notice bibliographique
Résumé
Hand-foot-mouth disease (HFMD) is a common acute infectious disease in children caused by various enteroviruses (EV). CV-A16 is one of the main pathogens of HFMD, leading to multiple outbreaks of HFMD worldwide, especially in the Asia-Pacific region. This study aims to investigate the molecular epidemiological characteristics of the coxsackievirus A16 (CV-A16) that cause HFMD in Hangzhou, Zhejiang Province from 2021 to 2024. A total of 2,105-laboratory diagnosis HFMD cases were collected, of which 529 were CV-A16 positive samples. The detected number of CV-A16 began to rise in March, peaked in May-August, and then decreased in September. Its distribution was highest in children aged 1-5 years, with more males than females. The phylogenetic analysis indicated that the B1a and B1b subgenotypes were simultaneously prevalent in Hangzhou from 2021 to 2023. The B1c evolutionary branch detected in Hangzhou in 2023 experienced a sudden increase in quantity in 2024, with the same proportion as B1a, suggesting a change in the subgenotype prevalence of CV-A16 virus. Evolutionary analysis also confirmed that the CV-A16 in Hangzhou is genetically stable and the B1a lineage emerged earlier, followed by B1b, while B1c is a newly emerging lineage. There were three specific amino acid variations (P3S, I235V, and T240A) in the VP1 sequence of B1c. These findings have expanded the global genetic resources of CVA16 and provided supporting evidence for the prevention and control of HFMD. Meanwhile, the CV-A16 B1c outbreak branch that emerged in Hangzhou from 2023 to 2024 also highlights the necessity of strengthening the monitoring of virus evolution and epidemiological dynamics in this region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».