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Enregistrement W4416239629 · doi:10.1016/j.xpro.2025.104199

Protocol for autofluorescence removal in microglia by photobleaching in free-floating immunofluorescent staining of mouse brain tissue

2025· article· en· W4416239629 sur OpenAlexafffund
Mark N Metri, Justin You, Jeehye Park

Notice bibliographique

RevueSTAR Protocols · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBruno and Ilse Frick Foundation for Research on ALSCanada Research Chairs
Mots-clésAutofluorescenceStainingMicrogliaPhotobleachingBrain tissueFrozen section procedure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autofluorescence in brain tissue poses a challenge in immunofluorescent staining by obscuring antibody-labeled proteins, mainly within microglia. Here, we describe a cost-effective protocol for removing autofluorescence in mouse brain sections by photobleaching. We outline steps to collect and section brain tissue, apply a photobleaching step using a light-emitting diode (LED), and perform immunofluorescent staining with primary and secondary antibodies. This protocol enables clearer visualization of microglial markers, particularly in mouse models of neurodegenerative diseases and aging. • Simple construction of a cost-effective photobleaching apparatus • Step-by-step techniques for photobleaching and immunofluorescent staining • Guidance on interpreting immunofluorescent images of disease-associated microglia Publisher’s note: Undertaking any experimental protocol requires adherence to local institutional guidelines for laboratory safety and ethics. Autofluorescence in brain tissue poses a challenge in immunofluorescent staining by obscuring antibody-labeled proteins, mainly within microglia. Here, we describe a cost-effective protocol for removing autofluorescence in mouse brain sections by photobleaching. We outline steps to collect and section brain tissue, apply a photobleaching step using an LED light, and perform immunofluorescent staining with primary and secondary antibodies. This protocol enables clearer visualization of microglial markers, particularly in mouse models of neurodegenerative diseases and aging.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0300,019

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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