Identifying sex-linked metabolomic biomarkers in fish gonads after bacterial infection
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Fish aquaculture faces sustainable production challenges. Among them are the pathogenic outbreaks that can compromise the health of the stocks from various perspectives, including broodstock reproduction. This study focused on identifying the metabolite alterations produced after a bacterial infection by Vibrio anguillarum in the gonads of European seabass (Dicentrarchus labrax). Sex-related response to the infection challenge was studied using a metabolomics approach. METHOD: The metabolome of testes and ovaries of adult fish were extracted and analyzed after 48 h of bacterial exposure by ultra-high-performance liquid chromatography-mass spectrometer using negative-mode electrospray ionization (ESI) (UHPLC-MS, Vanquish Horizon UHPLC coupled to a Thermo Fisher Scientific Q-Exactive HF). To further decipher the molecular events, metabolomic and transcriptomic data were interconnected. RESULTS: In total, 97 metabolites were identified. In the ovary, uric acid, O-phosphoethanolamine, allantoin, and acetoacetic acid were more represented. By contrast, nine metabolites were altered after the infection in testes, including uridine, N-acetylglucosamine-6-Phosphate, and Gamma-aminobutyric acid (GABA). The most abundant metabolic cascades triggered by infection in ovaries were related to glyoxylate and dicarboxylate metabolism, nitrogen metabolism, and purine metabolism, while in testes, we observed changes in glycerolipid metabolism, glycerophospholipid metabolism, and galactose metabolism. CONCLUSION: The present results demonstrate, for the first time in fish, that changes in metabolic pathways induced following infection are sex-dependent. The findings will help develop sex-specific immune therapies, identify resistant phenotypes, and improve aquaculture infection protocols.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».