Organic geochemical evidence for life in Archean rocks identified by pyrolysis–GC–MS and supervised machine learning
Notice bibliographique
Résumé
Throughout Earth's history, organic molecules from both abiogenic and biogenic sources have been buried in sedimentary rocks. Most of these organic molecules have been significantly altered by geologic processes through deep time. Nonetheless, the nature and distribution of those ancient fragmentary organic remains have the potential to reveal diagnostic biomolecular information after billions of years of burial. Here, we analyzed 406 fossil, modern biological, meteoritic, and synthetic samples using pyrolysis gas chromatography and mass spectrometry. We explored these analytical data via supervised machine-learning methods to discriminate samples of biogenic vs. abiogenic origin, plant vs. animal phylogenetic affinity, and photosynthetic vs. nonphotosynthetic physiology. Dividing 272 samples with known phylogenetic affinity and physiology into 9 categories, each further divided into 75% training and 25% testing sets, our random forest models accurately predict pairwise assignments of modern vs. fossil or meteoritic organics (100% correct assignments), fossil plant tissues vs. meteoritic organics (97%), modern vs. fossil plant tissues (98%), and modern plants vs. animal tissues (95%). Pairwise comparisons between fossil biogenic samples vs. abiogenic samples resulted in 93% correct classifications, while analysis of modern and ancient photosynthetic vs. nonphotosynthetic samples also resulted in 93% correct assignments. Our analyses demonstrate that molecular biosignatures can survive in ancient fossils and allow for the identification of organismal origins and traits. Consistent with previous morphological and isotopic inferences, we present evidence for biogenic molecular assemblages in Paleoarchean rocks (3.33 Ga) and for photoautotrophy in Neoarchean rocks (2.52 Ga).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».