Defining new Buruli ulcer endemic areas in urban southeastern Australia using bacterial genomics-informed possum excreta surveys
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Buruli ulcer in southeastern Australia is a zoonosis caused by infection with Mycobacterium ulcerans . Australian native possums are a major wildlife reservoir, and infected possums shed M. ulcerans in their excreta, with mosquitoes being the major transmitting vector in this region. Buruli ulcer is geographically restricted, and this feature, combined with an average 4.8-month incubation period, makes tracking M. ulcerans environmental spread and timely identification of new Buruli ulcer endemic areas challenging. While human mobility complicates transmission tracing, we used the highly territorial behavior of native possums and high-resolution pathogen genomics to confidently identify new Buruli ulcer endemic areas in Melbourne’s inner northwest and southern suburbs of Geelong. Using pathogen genomic phylodynamic modeling, we estimated that M. ulcerans was introduced to these areas 2–6 years before the emergence of human Buruli ulcer cases. This study shows how possum excreta surveys combined with pathogen genome data can pinpoint new Buruli ulcer endemic areas, thus providing critical local knowledge for targeted public health interventions to reduce exposure risk and ensure early diagnosis. IMPORTANCE Buruli ulcer is a debilitating skin disease caused by Mycobacterium ulcerans , with transmission in southeastern Australia involving native possums as wildlife reservoirs and mosquitoes as vectors. Early detection of new endemic areas is critical to preventing human disease, yet is hindered by the pathogen’s long incubation period, highly focal transmission, and the mobility of human hosts. This study demonstrates how structured possum excreta surveys, combined with high-resolution pathogen genomics, can confidently identify new Buruli ulcer endemic areas in southeastern Australia. By confirming local transmission in Melbourne’s inner northwest and Geelong through genome matching between possum- and human-derived M. ulcerans , we provide a framework for targeted, timely public health interventions. This integrated wildlife-environment-human approach exemplifies the power of One Health surveillance to detect and manage emerging zoonotic threats, offering a scalable model for other regions where Buruli ulcer is endemic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».