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Enregistrement W4416328424 · doi:10.1016/j.ajhg.2025.10.014

Bi-allelic PRMT9 loss-of-function variants cause a syndromic form of intellectual disability

2025· article· en· W4416328424 sur OpenAlexaff
Ariane Kröll‐Hermi, Corinne Stoetzel, Christelle Etard, Levon Halabelian, Élise Schaefer, Sophie Scheidecker, Kimia Kahrizi, Jamali Payman, Véronique Geoffroy, Megana Prasad, Cathy Obringer, Laurie Ruch, Hong Zeng, Fengling Li, Damien Plassard, Céline Keime, Francesca Mattioli, Claire Feger, Amélie Piton, Atsushi Fujita, Naomichi Matsumoto, Matheus Augusto Araújo Castro, Chong Ae Kim, Lyse Ruaud, Jonathan Lévy, Blandine Dozières, Anne‐Claude Tabet, Ingrid M. Wentzensen, Teresa Santiago‐Sim, Roman Yusupov, Kristian Tveten, Marie Falkenberg Smeland, Ebba Alkhunaizi, Gina Cowing, Chumei Li, Saskia B. Wortmann, René G. Feichtinger, Johannes A. Mayr, Hernán Gonorazky, Xiaodong Wang, Jia Wang, Tatjana Bierhals, Lev Grinstein, Theresia Herget, Anna Ruiz, Elisabeth Gabau, Antje Kampmeier, Olivier Kassel, Alma Kuechler, Konrad Platzer, Rami Abou Jamra, Audrey C. Woerner, Michaela J. Idleburg, Susanne Gerit Kircher, Franco Laccone, B. Golob, Borut Peterlin, Goran Čuturilo, Velibor Tasic, Caroline M. Kolvenbach, Friedhelm Hildebrandt, Luiza Ramos, Fernando Kok, Cecília Barbosa Buck, Ingrid M.B.H. van de Laar, de Man, Elifcan Taşdelen, Abdullah Sezer, Afife Büke, Zehra Yavuz, Selim Selçuk Çomoğlu, Carrie Costin, Frédéric Tran Mau‐Them, Elodie Lacaze, Thomas Courtin, Delphine Héron, Boris Keren, Sandra Whalen, J. Roume, Yanzhong Yang, Mariëtte J.V. Hoffer, Arie van Haeringen, Hossein Najmabadi, C.H. Arrowsmith, Uwe Strähle, Hélène Dollfus, Jean Muller

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoStructural Genomics ConsortiumMcMaster University Medical CentreHospital for Sick ChildrenPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and Stroke
Mots-clésMissense mutationIntellectual disabilityRNA splicingZebrafishCiliogenesisAutismNonsense-mediated decayMutationNeurodevelopmental disorder

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein arginine methyltransferase 9 (PRMT9) is part of the PRMT family, and it is suspected to function in pathways relevant to neurodevelopment. It is thought to participate in alternative splicing through interactions with the splicing factor SF3B2 (SAP145). In this study, we report 26 families (35 individuals) with bi-allelic loss-of-function variants in PRMT9, implicating PRMT9 in an autosomal-recessive human disease. Individuals primarily present with a neurodevelopmental disorder characterized by global developmental delay, learning disabilities, mild to severe intellectual disability, autism spectrum disorder, epilepsy, and hypotonia. The mutation spectrum includes 26 different variants such as frameshifting indels, nonsense variants, missense variants, and two copy-number variants. Mapping of the disease-causing missense variants onto the crystal structure of PRMT9 revealed that several of the variants reside within the catalytically active module of PRMT9, likely impairing its methyltransferase activity and resulting in a loss of function. In skin fibroblasts derived from affected individuals, we observed reduced expression at the RNA and/or protein level and subsequent aberrant methylation activity. Moreover, transcriptomic analysis of fibroblasts from affected individuals indicated differential expression of genes related to intellectual disability, autism, and cilia, suggesting a role of PRMT9 during ciliogenesis. Under ciliogenesis conditions, the skin-derived fibroblasts exhibited anomalies in the length of primary cilia but normal amounts of cilia. In addition, a prmt9 knockout zebrafish model displayed abnormal social preference in adult animals. Altogether, our findings implicate bi-allelic PRMT9 loss-of-function variants as causal for neurodevelopmental disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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