Swine acute diarrhea syndrome coronavirus-related viruses from bats show potential interspecies infection
Notice bibliographique
Résumé
bats in China and Southeast Asia, but their potential interspecies infection and pathogenicity remain unknown. Herein, we sequenced the spike (S) genes of bat SADSr-CoVs and classified them into four genotypes. We constructed an infectious SADS-CoV cDNA clone (rSADS-CoV) and nine recombinant viruses by replacing the SADS-CoV S gene with that of bat SADSr-CoVs. Recombinant SADSr-CoVs could replicate efficiently in respiratory and intestinal cell lines and human- and swine-derived organoids and caused varying tissue damage and mortality in suckling mice. These viruses can be classified into at least five serotypes based on cross-neutralization assays. Our findings highlight the potential risk of interspecies infection and provide important information for future surveillance of these bat viruses.IMPORTANCEOver the last 20 years, several bat-originated coronaviruses (CoVs), including SARS-CoV, MERS-CoV, and , have caused millions of deaths and severely disrupted global health systems, highlighting the need to investigate bat CoV spillover risks. SADS-CoV, another bat-derived CoV highly pathogenic to piglets, threatens the swine industry and exhibits broad cell tropism, underscoring the need to study these highly diverse viruses with potential for interspecies infection and pathogenicity. As part of our effort to understand these viruses, we developed a framework to characterize them in cell lines and organoids derived from swine and humans, as well as in suckling mice. Additionally, we performed serum cross-neutralization to classify bat SADSr-CoV serotypes, which could guide the development of broad-spectrum vaccines against SADSr-CoVs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».