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Enregistrement W4416363568 · doi:10.1094/phyto-08-25-0274-r

Characterization of a New Stripe Rust Resistance Gene on Chromosome Arm 2AL in Winter Wheat Cultivar Samara

2025· article· en· W4416363568 sur OpenAlexaff
Xiangyang Xu, Genqiao Li, Tezera W. Wolabu, Meinan Wang, Guihua Bai, Xianming Chen, Amy Bernardo, Ruolin Bian, Brett F. Carver, Yanqi Wu, Meriem Aoun

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensStillwater (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLocus (genetics)PopulationCultivarPlant disease resistanceStripe rustSingle-nucleotide polymorphismGeneCommon wheatChromosomeGlume

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stripe rust, caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici ( Pst), is a devastating wheat disease worldwide, and novel stripe rust resistance genes that can be readily used in wheat breeding are needed for sustainable wheat production. Winter wheat cultivar Samara exhibits high resistance to predominant Pst races in the United States. An F 2:3 population and an F 7 recombinant inbred line (RIL) population derived from the cross Samara × Jagalene were evaluated for responses to Pst race PSTv-37 at the seedling stage, leading to the conclusion that a single dominant gene conditions stripe rust resistance in Samara. A subset of F 2 plants was genotyped using genotyping-by-sequencing (GBS), and over 44,000 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified. Allele distribution analyses at each SNP locus revealed a genomic region harboring a stripe rust resistance gene, temporarily designated YrSA, in the terminal region of chromosome arm 2AL in Samara. Some GBS SNPs in the target region were converted to KASP markers, and linkage analysis delimited YrSA to an interval of 1.65 Mb between 784.71 and 786.36 Mb in the Chinese Spring IWGSC RefSeq v.2.1 reference sequence. The mapping results were further confirmed in the F 7 RIL population. YrSA is a new stripe rust resistance gene different from other genes previously reported on chromosome arm 2AL based on their locations, origins, and responses to Pst races. The physical order of YrSA with other permanently named Yr genes on 2AL is Yr1-Yr86-Yr32-YrSA. YrSA can be widely used to enhance wheat stripe rust resistance in the United States, and the newly developed KASP markers can be used in marker-assisted selection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,644
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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