Advancing the characterization of organic Cu(II)-binding ligands in Arctic Ocean waters: Integration of IMAC, SPE, HRMS, and fluorescence techniques
Notice bibliographique
Résumé
The availability and toxicity of dissolved copper (Cu) in the ocean are largely determined by its complexation with organic ligands, but the structure and origin of these ligands are still largely unknown. In this work, standard and marine Cu(II) complexing ligands were isolated using immobilized metal affinity chromatography (IMAC) and solid phase extraction (SPE), and characterized using high-resolution mass spectrometry (HRMS) and excitation-emission matrix (EEM) fluorescence to obtain information on the size distribution, molecular composition, and fluorescing properties of organic Cu(II)-binding molecules in the Arctic Ocean. We first investigated the retention performance of model ligands and found that N-containing ligands were preferentially isolated on the IMAC-SPE column. Application to Arctic Ocean dissolved organic matter (DOM) showed that the organic ligands accounted for up to 3 % of the DOM, consistent with previous studies. Robust correlations of HMRS peak intensities with EEM signals were used to expand chemical characterization of 511 molecular formulas in the IMAC-SPE and SPE extracts. The pairing based on the molecular classification associated with fluorescence signatures showed that 52 % Spearman correlations were linked to humic-like components. The necessity of multiple molecular annotation methods, like HRMS/fluorescence correlation or van Krevelen class attribution, was demonstrated to yield a better molecular identification. The combination of IMAC, SPE, HRMS, and EEM appears to be a promising approach for the characterization of organic Cu(II)-binding ligands in waters. • Copper organic ligands represented about 2–3 % of DOC in the northern Canada Basin • Only 7–25 % of the molecular peaks were found in both SPE and IMAC-SPE extracts • 61 % of the conjugated double-bond molecules correlated with PARAFAC components in the Cu-binding ligand pool
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».