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Enregistrement W4416386476 · doi:10.1038/s41597-025-06284-y

14,441 Genomics-Based Validated Automated Comprehensive Clinicopathologic Correlations for Myeloid Neoplasms

2025· article· en· W4416386476 sur OpenAlexaff
Ahmed Elsafty, Yomna Ahmed, Taher F. Halawa, Shaoguang Li, Dongguang Li, Elena Agranovsky, Ahmed M. Soliman, Howida Talaat, Mohamed Montaser, Omar Elnady, Deyaa Elnady, Mohamed Mahmoud Moustafa, Nourhan Ibrahim, Maryana Gumenyak, Yasmin Soliman, Samah Osman Ali, E. Abdelrahman, Hatem Alahwal, Ahmed Barefah, Ashraf Abdelghany, Sherif Ammar, Nermeen Abdel-Haleem, Osman Elsaid Adlan Abdelkareem, Samir Shamma, Naglaa Husein, Maha Mahmoud Hamed Sakr, Heba-Allah E. AbdElrhman, Menatalla K. Nadim, Hany Girguis, Manal Othman, Ola Soliman, Walaa H. Behery, Lamis M. El-toukhy, Fatma-Elzahraa A. Bebers, Mohamed Abdel Zaher, Mohamed A. Saada, Soha Khorshed, Khaled M. Talaat, Mohamed Mahmoud, Medhat Mahmoud, Abdel-Rahman Osama Abdel-Kareem, Haitham Heneish, Ibrahim I. Samaha, Mones Safwat, M. Talaat, Alaa O. Abdel-Kareem, Hadeel Abdel-Monem, Ramy Abaza, Hazem Abaza, May A. Maarouf, Iman A. Shaheen, Ahmed Samir Abdelhafiz, Amera Rabee, Yara M. Montaser

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthoritySpinologics (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyeloidMyeloid leukemiaDysplasiaPeripheral bloodMyeloid sarcomaBlood cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The dataset (Elsafty_Reports_of_Myeloid_Neoplasms_2024) consists of 14,441 comprehensive clinicopathologic correlations (CPCs) for myeloid neoplasms (MN) with corresponding laboratory results. Specialized online platform utilizing these laboratory results automatically generated the diagnostic and prognostic CPCs. These results include complete blood counts (CBC), peripheral blood smear (PBS) findings, blast/promyelocyte count with dysplasia screening by flow cytometry, and molecular results by NGS/PCR. Two Hematopathologists, who performed the CBC and PBS review, collected their 10,794 real-world reports of cases served in Egypt with molecular studies performed in the USA and Europe. These newly-diagnosed cases included 243 chronic myeloid leukemia (CML) cases with 257 mutations/aberrations; 4,567 non-CML MN cases with 7,883 Tiers I/II mutations/aberrations, amino acid changes, and allele frequencies; and 5,984 benign/inconclusive cases with negative NGS for myeloid mutations/aberrations in 66 DNA/RNA genes. Additionally, there are 3,647 CPCs with synthetic genomics simulating all new/follow-up CML cases and complex/rare non-CML MN cases. Stringent validation by 51 international professors/consultants/specialists from multiple medical centres confirmed 100% medical and clerical accuracy, referencing the WHO 5th edition and relevant esteemed publications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,501
Score d'incertitude au seuil0,968

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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