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Enregistrement W4416407902 · doi:10.1101/2025.11.16.688689

ProMPt: A modular preclinical platform for functional modelling of prostate cancer heterogeneity and therapeutic vulnerabilities

2025· preprint· W4416407902 sur OpenAlexaff
Nicole Pandell, Jacob Househam, Matteo Tartagni, Archana P. Thankamony, Florian Gabel, Roberto Rota, Elizabeth Flittner, Bora Gürel, Ines Figueiredo, George Seed, Antje Neeb, Mary Chol, Wei Yuan, John G. Clohessy, Christopher J. Tape, Adam Sharp, Johann S. de Bono, Marco Bezzi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesProstate Cancer UKCancer Research UKAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésProstate cancerProstateImmune systemOrganoidTranscriptomeCRISPRDiseaseImmunotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Prostate cancer progression is driven by heterogenous genetic, phenotypic, and microenvironmental programs that remain challenging to model experimentally. Existing systems such as genetically engineered mouse models, xenografts, and patient-derived organoids have each advanced mechanistic insight but are limited by genetic scope, scalability, or lack of immune context. To overcome these constraints we developed ProMPt, a genetically-defined syngeneic mouse modelling platform that captures combinations of the most recurrent clinical prostate cancer genomic alterations to enable scalable in vitro and in vivo interrogation of prostate cancer evolution. Tumours derived from ProMPt organoids recapitulate the histologic and molecular diversity of human disease. Cross - species transcriptomic integration and multivariate single-cell analysis under defined culture permutations revealed conserved phenoscapes, highlighting a central role for MYC in disease progression and therapy resistance. Guided by these insights, preclinical intervention studies demonstrated that combined MAPK inhibition and blockade of protein translation synergistically suppressed tumour growth in castration-resistant models. This combination not only suppressed proliferation but also remodelled the tumour immune landscape, underscoring its dual epithelial and microenvironmental effects. Together, these findings establish ProMPt as a versatile framework for linking genotype, lineage plasticity, and therapeutic vulnerability in prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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