Proteomics reveals substantial differences between in vitro matured abattoir-derived and in vivo matured oocytes in cattle
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
In vitro production (IVP) of bovine embryos still has its limitations, such as low blastocyst rate and lower embryo quality, resulting in lower pregnancy rates following transfer compared to in vivo produced embryos. Transcriptional studies comparing both types of embryos mainly utilized oocytes retrieved from slaughterhouse material for IVP, thereby introducing the possibility, that differences between IVP and in vivo embryos are in part attributable to differing sources of oocytes. The aim of the present study was therefore to compare the proteome of oocytes retrieved from slaughterhouse material, with and without a period of in vitro maturation, and in vivo matured oocytes obtained from superovulated donor cattle. For each group the protein pattern of four technical replicates containing ten oocytes each were analyzed via SWATH™-MS. In total, 1208 proteins were detected, 160 of which were differentially abundant in at least one group comparisons. Clustering analysis revealed that oocyte maturation environment is the primary driver of molecular difference, with the in vitro matured oocytes exhibiting a highly distinct proteome compared to both the in vivo matured and immature oocytes. In vitro matured oocytes were characterized by an overall enhanced translational activity affecting mainly proteins involved in energy metabolism, transcription and translation, and oocyte activation. An organized regulation of key pathways was observed during oocyte maturation in vivo, e.g. activation of autophagy and apoptosis pathways, while changes in protein abundance in vitro seem to be undirected. This deregulation of the proteome in in vitro matured oocytes likely negatively affect subsequent developmental events.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle