The pcnB gene sustains Shigella flexneri virulence
Notice bibliographique
Résumé
The enteropathogen Shigella flexneri employs a Type Three Secretion System (T3SS) to colonize intestinal epithelial cells. Genes encoding the T3SS are located on a large IncFII virulence plasmid, pINV. T3SS expression comes at the expense of slowed Shigella growth and is therefore strictly controlled by both transcriptional and post-transcriptional mechanisms. Following up on a recent genome-wide screen, we here show that the chromosomal gene pcnB, encoding the poly-A polymerase I (PAP-I), slows Shigella growth at 37°C, while it at the same time promotes early colonization of a human epithelial enteroid model. Proteomic profiling revealed that pcnB drives global increase of the Shigella T3SS virulence program. Accordingly, pcnB upholds pINV replication to a level favourable for Shigella virulence. This is achieved through increased degradation of the antisense RNA CopA, involved in plasmid replication control. The pcnB effect on pINV replication was found to also ensure longer-term intraepithelial expansion of Shigella following human intestinal epithelium invasion. Our findings exemplify how an adequate pINV level, sustained by pcnB, underpins the successful execution of Shigella´s infection cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».