Molecular controls of T-lineage differentiation and thymus engraftment from human induced pluripotent stem cells 2056
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Description The primary cell sources of T cell-based immunotherapies are autologous mature T cells from patients. Mature T cells are expanded in vitro and infused back for treatment after being armed by genes like chimeric antigen receptors. T cell resources limit this strategy. Human induced pluripotent stem cells (iPSC), which can be differentiated into mature T lineage cells in vitro, provide a potential alternative cellular source. We envision a strategy of transplanting iPSC-derived progenitor T cells (Pro-T) that are able to engraft the host thymus and develop into self-tolerant and self-MHC-restricted mature T cells via intrathymic selection steps. However, the successful engraftment of either iPSC-derived hematopoietic stem cells or Pro-T remains a major unresolved challenge. Our research aims to determine the necessary molecular cues required for iPSC-derived Pro-T thymus engraftment to enable the strategy. Our single-cell RNA-seq data shows that iPSC-derived Pro-T are more similar to fetal Pro-T than adult thymus, with a high signature Lin28b RNA expression. We used a fetal thymic organ culture (FTOC) approach to test thymus engraftment and RNA-seq to show that knocking-out LIN28B expression allows iPSC-derived Pro-T to engraft FTOCs, similar to cord blood-derived Pro-T. By further exploring LIN28B’s function during human T cell development, targeted LIN28B pathway inhibition could be used to enhance the iPSC-derived Pro-T engraftment ability for future clinical applications. Funding Sources Funding was provided by Grant 1158417 from the Cancer Research Society and the Leukemia & Lymphoma Society of Canada. Topic Categories Hematopoiesis and Immune System Development (HEM)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».