CD137 signals program the TCR⍺β+ CD8⍺⍺ intraepithelial lymphocyte population for survival 2139
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Description A population of TCRαβ+ CD8αα Intraepithelial Lymphocytes (IEL) reside in the intestine and perform regulatory roles. While most developing αβ T cells that experience agonist signals in the thymus are deleted as a central tolerance mechanism, thymic precursors of TCRαβ+ CD8αα IEL (IELp) require agonist TCR signals for selection, however, other signals that promote the generation of this unique intestinal T cell population are not fully understood. To gain insight into gene expression differences that underly IELp selection, we completed a trajectory analysis of thymic IELp using scRNA-seq and flow cytometry. We identified CD137, a costimulatory receptor in the TNF receptor superfamily, as a candidate for contributing to IELp maturation. CD137 was expressed on both thymocytes with a gene expression profile characterizing clonal deletion and IELp selection. CD137 was upregulated during thymic IELp development and maintained in the periphery on the most highly self-reactive IELp. Analysis of CD137-deficient mice and competitive mixed bone marrow chimeras supported a role for CD137 in generating CD8αα IEL but not thymic IELp maturation, nor in upregulating of trafficking molecules needed to enter the intestinal epithelium. However, in vitro culture with IL-15 suggested a survival defect in CD137-deficient IEL. Taken together, our data suggest that the most highly TCR signaled IELp receive CD137 signals that program them for long-term survival as intestinal residents. Funding Sources Supported by a CIHR Project Grant. Topic Categories Hematopoiesis and Immune System Development (HEM)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».