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Enregistrement W4416447327 · doi:10.1093/jimmun/vkaf283.1078

Streamlined mouse tumor processing with STEMprep™: Automated, Efficient, and Reliable 3260

2025· article· en· W4416447327 sur OpenAlexaff
Frann Antignano, Grace F. T. Poon, Sangyeob Lee, Alistair Chenery, Alice Liang, Payam Zachkani, Andrew Nobles, Bilal El yassem, Chris Ryan, Marc Delorme, Rodrigo Martins, Martin O’Keane, Andy I. Kokaji, Allen Eaves, Sharon A. Louis

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensTerry Fox Research InstituteStemcell Technologies
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTumor microenvironmentImmunotherapyMelanomaCancer immunotherapyCellViability assayPhenotypeCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Description The tumor microenvironment is highly heterogeneous, composed of diverse cell types with distinct phenotypes and characteristics. Gaining insights into these differences is essential for advancing cancer immunotherapy and research. Reliable results demand high-quality samples and standardized processing, however, generating single-cell suspensions from solid tumors is challenging due to variations in tumor type, size, texture, and developmental stage. Balancing enzymatic and mechanical dissociation is critical to preserve cell viability and yield. We developed the STEMprep™ Mouse Tumor Dissociation Kit for use with the STEMprep™ Automated Tissue Dissociation System, featuring a user-friendly instrument and specially designed sample tubes. This system includes an optimized enzyme formulation and a single protocol that works across diverse tumor types. Our findings demonstrate consistently high cell viability and yield (cells/mg tissue) across tumors: soft B16 melanoma (91.2 ± 3.3% and 1.5E4 ± 7.4E3 [n = 15]), medium-firm CT26 colon carcinoma (82.9 ± 6.1% and 2.6E4 ± 1.3E4 [n = 9]), and firm 4T1 mammary carcinoma (88.5 ± 4.0% and 2.7E4 ± 1.7E4 [n = 4]). This method maintains cell integrity and epitope availability for downstream analysis. Furthermore, STEMprep™-processed samples are compatible with EasySep™ magnetic cell isolation technology, and are functional in T cell suppression assays, enhancing tumor research workflows with efficiency, consistency, and reliability. Topic Categories Tumor Immunology: Cellular Responses and Tumor Microevironment (TIME)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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