GITR induced transcriptional co-regulator PRDM16 selectively enhances T cell memory in the lung tissue following respiratory influenza infection 4025
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Description GITR, a costimulatory TNFR superfamily member plays an important role in effector and memory CD8 T cell accumulation in the lung following influenza A virus infection (IAV). PRDM16 is a transcriptional coregulator known for its role in fatty acid metabolism and mitochondrial biogenesis in brown adipose tissue and hematopoietic stem cells. We previously identified Prdm16 as one of the most significantly upregulated genes induced by GITR signaling during chronic LCMV infection (Chang et al. Immunity 2017). Here we show that conditional knockout of Prdm16 in T cells results in a selective defect in effector and tissue resident memory CD8 T cells in the lung tissue with minimal effects in the secondary lymphoid organs and a trend towards increased Teffector responses in the lung during respiratory IAV infection. Conversely, overexpression of Prdm16 in OT-I T cells followed by adoptive transfer and IAV infection resulted in decreased effector T cell responses but increased memory T cell responses in the lung tissue compared to mock transduced OT-I T cells. Single cell RNA-sequencing of WT and Prdm16-/- CD8 T cells from mixed bone marrow chimeras following IAV infection suggests that PRDM16 induces a distinct state in the WT effector T cells that is not observed in the Prdm16-/- T cells. Our study identifies PRDM16 as an important regulator of memory T cells in the lung tissue with work in progress to identify mechanism. Funding Sources Funding: This research was supported by Canadian Institutes for health research grants #FDN-143250 and PJT-178020 (to T.H.W),an Ontario Graduate Scholarship (to KY) and Emerging & Pandemic Infections Consortium Doctoral Awards to S.L. and K.Y. T.H.W. holds the Canada research chair in anti-viral immunity at the University of Toronto. Topic Categories Viral Immunology (VIR)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».