Cx3cr1 deficiency alters renal-infiltrating immune cell transcriptional landscape in lupus-prone MRL/lpr mice 2274
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Description Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disorder characterized by aberrant immune responses and chronic inflammation. CX3CR1, a chemokine receptor, plays a critical role in immune cell trafficking and lupus pathogenesis. We previously found that Cx3cr1 deficiency exacerbates murine lupus nephritis, but the mechanisms remain unclear. Using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), we analyzed renal-infiltrating CD45+ leukocytes from wild-type (WT) and Cx3cr1-knockout (KO) lupus-prone MRL/lpr mice. scRNA-seq revealed transcriptional changes in T cells, B cells, NK cells, neutrophils, monocytes, macrophages, and dendritic cells. In KO mice, macrophages exhibited upregulation of complement-related genes, including C1qa, C1qb, C1qc, and C3ar1, indicating enhanced complement activation. In addition, Egfr was upregulated in CD4 T cells, dendritic cells, B cells, NK cells, neutrophils, double negative T cells, and macrophages, suggesting a role for epidermal growth factor (EGF) in autoimmune activation and proliferation. Pathway analysis showed activation of complement, coagulation, and EGF-associated pathways in various immune cell subsets. These findings suggest that Cx3cr1 deficiency alters the transcriptional landscape of renal-infiltrating immune cells to exacerbate lupus nephritis in MRL/lpr mice. Topic Categories Basic Autoimmunity (BA)
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».