Functional characterization of PAX5 gene circular products in B-cell development and function 4458
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Description PAX5 is crucial for B-lineage commitment and adaptive immunity. Recently, we identified a novel class of PAX5 products in B cells: circular RNAs (circRNAs). Given PAX5’s central role in B-cell biology, we hypothesized that PAX5 circRNAs (circPAX5) contribute to B-cell development and function. Using deep sequencing of B-cell lines and primary peripheral blood B-lymphocytes, we mapped 10 distinct circPAX5 isoforms comprising various exon and intron combinations from the PAX5 locus. Notably, the most abundant isoform, circPAX5 2-5, encompasses sequences exons 2 to 5. To explore circPAX5 signaling pathways, we isolated circPAX5 complexes from B-cell lines and characterized their co-interacting partners (miRNAs and proteins) via deep sequencing and mass spectrometry. Intriguingly, circPAX5 interacted with distinct signaling partners depending on the B-cell developmental stage. These findings suggest that circPAX5 plays stage-specific roles by engaging unique interaction networks across B-cell subtypes. To assess circPAX5’s phenotypic impact, we conditionally expressed circPAX5 in various B-cell lines. Similarly, we found that circPAX5 silencing altered cellular growth rates in a differentiation state- and subtype-dependent manner. Altogether, we present circPAX5 products as a new layer of signaling networks mediating B-cell biology. The functional elucidation of circPAX5 products may provide new insight to mechanisms supporting B-cell differentiation and immune development. Funding Sources Supported by NSERC-DDG-2020-00005 Topic Categories Hematopoiesis and Immune System Development (HEM)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».