The transcription factor AFF3 maintains naïve CD8 T cell quiescence restraining premature cell activation allowing for optimal T cell response to viral infection 3057
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Description Quiescent naïve CD8 T cells are poised to rapidly proliferate upon activation to eliminate infected and cancerous cells. The mechanisms that control naïve CD8 T cell quiescence is incompletely understood. We identified the transcription factor AF4/FMR2 Family Member 3 (Aff3) as a novel regulator of CD8 T cell quiescence to prevent premature activation and differentiation. To determine the role of AFF3 in CD8 T cells we designed a T cell specific conditional AFF3 knockout (KO) mouse model. Total RNA-sequencing data show that the largest differences in gene expression occur between naïve and recently activated CD8 T cells and involve pathways linked to TCR signaling and metabolism. Although at baseline naïve CD8 AFF3 KO T cells do not develop an antigen-experienced phenotype, they have higher ERK phosphorylation. In co-adoptive transfer experiments, KO cells are present at a higher frequency at 5 days post infection (dpi) but at a lower frequency at 8 dpi compared to the WT cells following acute LCMV infection, indicating an accumulation defect. This deficit is partially restored by rapamycin treatment suggesting that AFF3 may regulate mTORc1 activation. When naïve CD8 T cells are stimulated ex vivo, KO cells activate and enter the cell cycle more rapidly but fail to sustain proliferation compared to WT. Together, our data suggest that AFF3 is important to maintain naïve CD8 T cell quiescence leading to optimal accumulation and function of CD8 T cells in viral infection. Funding Sources CTSI BRG, IUSCC HHM, IUSM Topic Categories Lymphocyte Differentiation and Peripheral Maintenance (LYM)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».