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Enregistrement W4416451661 · doi:10.1080/15548627.2025.2593585

Regulation of pexophagy by a novel TBK1-MARCHF7-PXMP4-NBR1 axis in PEX1-depleted HeLa cells

2025· article· en· W4416451661 sur OpenAlexaff
Yong Hwan Kim, Joon Bum Kim, Ji-Eun Bae, Na Yeon Park, Seong Hyun Kim, Jae‐Young Um, Dong‐Seok Lee, Kyu‐Sun Lee, Peter K. Kim, Doo Sin Jo, Dong‐Hyung Cho

Notice bibliographique

RevueAutophagy · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesKorea Institute for Advancement of TechnologyNational Research Foundation of KoreaMinistry of Science and ICT, South KoreaMinistry of Food and Drug SafetyMinistry of Trade, Industry and EnergyNational Research Foundation
Mots-clésUbiquitinUbiquitin ligasePhosphorylationPeroxisomeUbiquitin-Protein LigasesDownregulation and upregulationGene knockdownSerineSUMO protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peroxisomes are essential for lipid metabolism and redox balance, with pexophagy playing a critical role in maintaining cellular homeostasis. However, the regulatory mechanisms of pexophagy remain unclear. Through functional screening, we identified MARCHF7 as a novel E3 ligase regulating pexophagy. MARCHF7 depletion impaired pexophagic flux under PEX1 knockdown conditions. MARCHF7 binds to PXMP4 and promotes its ubiquitination at lysine 20 in PEX1-deficient cells. Depletion of PXMP4 impairs pexophagy, and reconstitution with the PXMP4 lysine 20 ubiquitination-defective mutant failed to rescue pexophagy. PEX1 depletion also induces TBK1 phosphorylation at serine 172, activating TBK1, which subsequently phosphorylates MARCHF7. This activation is driven by ROS accumulation, which reduces PXMP4 ubiquitination and prevents peroxisome loss. Furthermore, downregulation of MARCHF7 or PXMP4 impairs NBR1 recruitment to peroxisomes, suggesting that ubiquitinated PXMP4 acts as a recognition signal for NBR1. Collectively, our findings establish the TBK1-MARCHF7-PXMP4-NBR1 axis as a key regulatory pathway for pexophagy in response to PEX1 depletion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,163
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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