Expression of Tetraspanin 4 Relative to Therapy-induced Senescence Markers in Breast Cancer in Response to Neoadjuvant Chemotherapy
Notice bibliographique
Résumé
Therapy-induced senescence (TIS) is a component of breast cancer (BC) treatment. Tetraspanins have emerging roles in cancer biology. Tetraspanin 4 (TSPAN4 [ NAG2 ]) has been implicated in tumor progression, however, its association with TIS remains unexplored. We investigated TSPAN4 expression in BC samples from patients who received neoadjuvant chemotherapy (NAC) and its association with TIS markers. Thirty-eight paired pre- and post-NAC BC samples were analyzed using immunohistochemistry (IHC) staining for TSPAN4 and TIS-associated biomarkers (Lamin B1 and Ki67). Pairwise analysis of senescence-related gene expression ( LMNB1, MKI67, CDKN1A, ATM, IGFBP7, MMP2, CXCL14 , and CCL5) was performed in an independent geneset of 68 paired pre- and post-NAC BC patient samples. NAC reduced the expression of senescence-associated proliferation markers Ki67 and Lamin B1 in BC samples, with 84% and 76% of patients showing decreased expression, respectively ( p <0.001). Senescence-associated gene expression analysis revealed consistent upregulation of CDKN1A, ATM, IGFBP7, MMP2, CXCL14 , and CCL5 post-NAC ( p <0.001), while LMNB1 and MKI67 were significantly downregulated ( p<0.0001 and p =0.007, respectively). A subset (15/38; 39%) of samples demonstrated upregulation of the TSPAN4 expression post-NAC ( p <0.01). NAG2 was upregulated in 54/68 patients post-NAC ( p <0.00001) and its expression correlated positively with senescence-associated genes. An association between TSPAN4 and TIS post-NAC was identified.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».