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Enregistrement W4416458352 · doi:10.3390/genes16121394

A Single-Cell Omics Technical Guide for Advancing Neuropsychiatric Research

2025· article· en· W4416458352 sur OpenAlexaff
Kayleigh Casmey, Maria Zimmermann, Yuxin Xie, Sierra A. Codeluppi, Gustavo Turecki

Notice bibliographique

RevueGenes · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOmicsDementiaGenomicsDiversity (politics)Human brainTranscriptome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Single-cell omics technology has advanced rapidly since its inception, offering increasing precision, resolution, and technical diversity to explore cell-specific molecular features in the human brain and neuropsychiatric disorders. While traditional bulk genomic analyses have provided valuable insights into the molecular processes of these disorders, single-cell omics allows for the investigation of cellular heterogeneity in the brain, which is crucial for dissecting underlying pathology. Neuropsychiatric disorders-such as dementia and depression-are complex and heterogenous brain disorders driven by intricate interactions of genetic and environmental factors. Methodological developments in single-cell omic technologies have enabled their application directly to human brain tissue for the study of neuropsychiatric disorders, yielding cell-specific insights in transcriptomics and epigenomics, with emerging findings in proteomics, metabolomics, multi-omics, and beyond. This review discusses different single-cell omic technologies, focusing on their application to postmortem human brain tissue, highlighting key findings from the use of these methods in neuropsychiatric disorders, and providing considerations for future implementation to elucidate the molecular landscape of brain changes associated with these conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,426
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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