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Enregistrement W4416528840 · doi:10.1080/17501911.2025.2591594

Integrating gut microbiome and host transcriptomics for the personalized management of IBD

2025· article· en· W4416528840 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEpigenomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigenomicsMicrobiomeDysbiosisInflammatory bowel diseaseGut floraTranscriptomeDiseasePrecision medicineUlcerative colitis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inflammatory bowel disease (IBD), including Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), affects an estimated 6.8 million individuals worldwide. Although biological or small molecule drug therapies can improve patient outcomes, loss of response to treatment over time remains high, highlighting the need for new precision medicine strategies. Dysbiosis of the gut microbiome is characterized by the loss of beneficial microbes and an overgrowth of pro-inflammatory pathobionts. In IBD, gut dysbiosis contributes to chronic intestinal inflammation via altered metabolite profiles and epithelial barrier disruption. Recent advancements in multi-omics integration offer approaches to better understand the pathogenesis of IBD. Epigenomic studies have revealed disease-specific DNA methylation and enhancer activation patterns that reshape immune pathways and compromise epithelial barrier integrity, key mechanisms in IBD pathophysiology. These molecular signatures allow for the stratification of IBD patients into distinct subgroups, allowing for more targeted therapeutic strategies. Here we explore the potential benefits of integrating gut microbiome and both host transcriptomics and epigenomics to improve disease management in IBD patients. While challenges remain - such as data standardization, computational complexity, and cost - the progression of multi-omics methodologies is expected to improve patient outcomes by reducing high treatment failure rates in IBD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,690
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle