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Enregistrement W4416529739 · doi:10.1101/2025.11.20.689592

Optimizing the membrane composition of immobilized giant vesicles for effective entrapment and observation of motile bacteria

2025· preprint· W4416529739 sur OpenAlexafffund
P. Chu, Liu Yu, Cécile Fradin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEntrapmentVesicleMembraneLaurdanContext (archaeology)BacteriaMembrane fluidity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Artificial lipid vesicles are an elegant way of producing auto-assembled customizable chambers, and they have been widely studied for entrapping small molecules in the context of drug delivery. However, their use for microorganism entrapment remains largely unexplored. One obstacle is the generation of giant vesicles (GVs) large and rigid enough to contain potentially mobile micron-size organisms in a way that results in efficient cell encapsulation. To address this challenge we developed a modified version of the previously described gel-assisted swelling method, in which immobilized GVs are formed by hydrating a lipid film deposited on agar with a heated solution. We used solutions containing Magnetospirillum magneticum strain AMB-1 cells to test for bacterial entrapment. Systematically exploring POPC:DOPS:cholesterol ternary mixtures to vary the surface charge and rigidity of the GVs’ membrane allowed the determination of specific conditions leading to the efficient entrapment of these highly mobile cells. Lipid order measurements with the fluorescent membrane probe Laurdan show that entrapment is associated with a significant decrease in membrane rigidity between the swelling and entrapment steps. The high sensitivity of successful entrapment on DOPS concentration further suggests that membrane fluctuations play a major role in allowing the micron-size bacteria to push through the membrane and break in and out of the GVs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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