A Novel Chimeric Molecule of Heparanase and Ig-Fc Enables Histochemical and Cytochemical Detection of O-sulfated Heparan Sulfate
Notice bibliographique
Résumé
A chimeric protein of heparanase and Ig-Fc was designed as a novel tool to expand the detection of structurally heterogeneous heparan sulfate (HS) and related glycosaminoglycans. The whole mouse heparanase gene was combined with the gene segment encoding the mouse IgG1 hinge-Fc domain. A point mutation E335A was inserted to disable putative HS degradation activity. Chimeric proteins consisted of the latent form of the enzyme devoid of HS degradation activity. The chimeric proteins bound to heparin, N-desulfated heparin, and O-sulfated N-acetylheparosan. Their binding spectrum to glycosaminoglycans differed from that of anti-HS mAb 10E4. The chimeric proteins bound to Kato III and A549 cell lines. The binding was reduced by knocking down EXT1 gene expression. One of the chimeric proteins stained the epidermal cells in the hyperplastic spinous layer of inflamed atopic dermatitis skin and inflammatory cells in the dermis, which were not stained with mAb 10E4. The protein stained a polarized structure on the surface of monocytic U937 and THP1 cells. Similar polarized structures were observed with anti-syndecan-1 antibody staining. The chimeric protein and anti-syndecan-1 antibody precipitated similar sets of proteins that included syndecan-1 from the lysates of U937 cells. These novel chimeric proteins are useful to detect HS abundant in O-sulfation in histochemical, cytochemical, and biochemical studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».